基因关联分析的修正方法及修正装置

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基因关联分析

专利权:清华大学

作者:索津莉;鲍峰;戴琼海;

 

一:权力要求书

1.一种基因关联分析的修正方法,其特征在于,包括以下步骤:

获取序列步骤:根据训练的隐马尔可夫模型学习到的生成概率分布获取新的样本的基因序列;

生成样本步骤:根据所述新的样本的基因序列生成新的样本;

标签赋值步骤:对所述新的样本进行标签赋值,其中,将所述新的样本与预设的患病以及健康的样本进行对比,以确定所属类别并放弃或者保留;以及似然比检验步骤:重复执行所述获取序列步骤、生成样本步骤和所述标签赋值步骤,以得到满足预设条件的多个样本,并获取新的数据集,以进行基于回归方程的似然比检验。

2.根据权力要求1所述的基因关联分析的修正方法,其特征在于,所述训练的隐马尔可夫模型的训练方法包括:

检测基因核苷酸多态性位点(snp)si上游下游位置的L个snp;

根据所述L个snp得到基因集合Si(n);

在所述基因集合si(n)上,通过隐马尔科夫模型对序列进行建模,并通过训练所述隐马尔科夫模型到生成模型的参数集Θ,以得到所述训练的隐马尔可夫模型。

3.根据权力要求2所述的基因关联分析的修正方法,其特征在于,所述得到所述训练的隐马尔科夫模型,进一步包括:

通过最大化所述参数集